توضیحات
This unique text/reference presents a concise guide to building computational gene finders, and describes the state of the art in computational gene finding methods, with a particular focus on comparative approaches. Fully updated and expanded, this new edition examines next-generation sequencing (NGS) technology, including annotation pipelines for NGS data. The book also discusses conditional random fields, enhancing the broad coverage of topics spanning probability theory, statistics, information theory, optimization theory, and numerical analysis.
Topics and features: introduces the fundamental terms and concepts in the field, and provides an historical overview of algorithm development; discusses algorithms for single-species gene finding, and approaches to pairwise and multiple sequence alignments, then describes how the strengths in both areas can be combined to improve the accuracy of gene finding; explores the gene features most commonly captured by a computational gene model, and explains the basics of parameter training; illustrates how to implement a comparative gene finder, reviewing the different steps and accuracy assessment measures used to debug and benchmark the software; examines NGS techniques, and how to build a genome annotation pipeline, discussing sequence assembly,de novorepeat masking, and gene prediction (NEW).
Postgraduate students, and researchers wishing to enter the field quickly, will find this accessible text a valuable source of insights and examples. A suggested course outline for instructors is provided in the preface.
————————————————————–
ترجمه ماشینی :
این متن/مرجع منحصربهفرد راهنمای مختصری برای ساخت یابهای ژن محاسباتی ارائه میکند و وضعیت هنر در روشهای یافتن ژن محاسباتی را با تمرکز ویژه بر رویکردهای مقایسهای توصیف میکند. این نسخه جدید که کاملاً به روز شده و گسترش یافته است، فناوری نسل بعدی توالی یابی (NGS) را بررسی می کند، از جمله خطوط لوله حاشیه نویسی برای داده های NGS. این کتاب همچنین زمینههای تصادفی شرطی را مورد بحث قرار میدهد و پوشش گسترده موضوعاتی را که شامل نظریه احتمال، آمار، نظریه اطلاعات، نظریه بهینهسازی و تحلیل عددی میشود، افزایش میدهد.
موضوعات و ویژگیها: اصطلاحات و مفاهیم اساسی در میدان، و یک نمای کلی تاریخی از توسعه الگوریتم ارائه می دهد. الگوریتمهایی را برای یافتن ژن تکگونهای، و رویکردهایی برای همترازیهای توالیهای دوتایی و چندگانه مورد بحث قرار میدهد، سپس توضیح میدهد که چگونه میتوان نقاط قوت در هر دو حوزه را برای بهبود دقت یافتن ژن ترکیب کرد. ویژگیهای ژنی که معمولاً توسط یک مدل ژن محاسباتی ثبت میشوند را بررسی میکند و اصول اولیه آموزش پارامتر را توضیح میدهد. نحوه اجرای یک ژن یاب مقایسه ای را نشان می دهد، مراحل مختلف و اقدامات ارزیابی دقت مورد استفاده برای اشکال زدایی و محک زدن نرم افزار را مرور می کند. تکنیکهای NGS و نحوه ایجاد خط لوله حاشیهنویسی ژنوم را بررسی میکند، در مورد مونتاژ توالی،de novorepeat masking و پیشبینی ژن (جدید) بحث میکند.
دانشجویان و محققانی که مایلند برای ورود سریع به میدان، این متن قابل دسترس را منبع ارزشمندی از بینش ها و مثال ها خواهد یافت. یک طرح کلی دوره پیشنهادی برای مدرسان در پیشگفتار ارائه شده است.
tag : دانلود کتاب یافتههای مقایسهای ژن: مدلها، الگوریتمها و پیادهسازی , Download یافتههای مقایسهای ژن: مدلها، الگوریتمها و پیادهسازی , دانلود یافتههای مقایسهای ژن: مدلها، الگوریتمها و پیادهسازی , Download Comparative gene finding: models, algorithms and implementation Book , یافتههای مقایسهای ژن: مدلها، الگوریتمها و پیادهسازی دانلود , buy یافتههای مقایسهای ژن: مدلها، الگوریتمها و پیادهسازی , خرید کتاب یافتههای مقایسهای ژن: مدلها، الگوریتمها و پیادهسازی , دانلود کتاب Comparative gene finding: models, algorithms and implementation , کتاب Comparative gene finding: models, algorithms and implementation , دانلود Comparative gene finding: models, algorithms and implementation , خرید Comparative gene finding: models, algorithms and implementation , خرید کتاب Comparative gene finding: models, algorithms and implementation ,
نقد و بررسیها
هنوز بررسیای ثبت نشده است.