توضیحات
Data in the genomics field is booming. In just a few years, organizations such as the National Institutes of Health (NIH) will host 50+ petabytesor over 50 million gigabytesof genomic data, and theyre turning to cloud infrastructure to make that data available to the research community. How do you adapt analysis tools and protocols to access and analyze that volume of data in the cloud? With this practical book, researchers will learn how to work with genomics algorithms using open source tools including the Genome Analysis Toolkit (GATK), Docker, WDL, and Terra. Geraldine Van der Auwera, longtime custodian of the GATK user community, and Brian OConnor of the UC Santa Cruz Genomics Institute, guide you through the process. Youll learn by working with real data and genomics algorithms from the field. This book covers: Essential genomics and computing technology background Basic cloud computing operations Getting started with GATK, plus three major GATK Best Practices pipelines Automating analysis with scripted workflows using WDL and Cromwell Scaling up workflow execution in the cloud, including parallelization and cost optimization Interactive analysis in the cloud using Jupyter notebooks Secure collaboration and computational reproducibility using Terra
————————————————————–
ترجمه ماشینی :
داده ها در زمینه ژنومیک در حال رونق است. تنها در چند سال، سازمانهایی مانند مؤسسه ملی سلامت (NIH) میزبان بیش از 50 پتابایت یا بیش از 50 میلیون گیگابایت از دادههای ژنومی خواهند بود و به زیرساختهای ابری روی میآورند تا این دادهها را در دسترس جامعه تحقیقاتی قرار دهند. چگونه ابزارها و پروتکل های تجزیه و تحلیل را برای دسترسی و تجزیه و تحلیل آن حجم از داده ها در فضای ابری تطبیق می دهید؟ با استفاده از این کتاب کاربردی، محققان یاد خواهند گرفت که چگونه با الگوریتمهای ژنومیک با استفاده از ابزارهای منبع باز از جمله جعبه ابزار تجزیه و تحلیل ژنوم (GATK)، Docker، WDL و Terra کار کنند. Geraldine Van der Auwera، متولی قدیمی جامعه کاربران GATK، و برایان OConnor از مؤسسه ژنومیک UC Santa Cruz، شما را در این فرآیند راهنمایی میکنند. شما با کار با داده های واقعی و الگوریتم های ژنومیک از این زمینه یاد خواهید گرفت. این کتاب موارد زیر را شامل میشود: پیشزمینه فناوری محاسباتی و ژنومیک اساسی عملیات محاسبات ابری اولیه شروع با GATK، بهعلاوه سه خط لوله مهم بهترین روشهای GATK، تجزیه و تحلیل خودکار با گردشهای کاری اسکریپتشده با استفاده از WDL و Cromwell افزایش مقیاسبندی اجرای گردش کار در ابر، از جمله موازیسازی و بهینهسازی هزینه، تحلیل تعاملی در ابر با استفاده از نوتبوکهای Jupyter همکاری امن و تکرارپذیری محاسباتی با استفاده از Terra
tag : دانلود کتاب ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra , Download ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra , دانلود ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra , Download Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra Book , ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra دانلود , buy ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra , خرید کتاب ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra , دانلود کتاب Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra , کتاب Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra , دانلود Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra , خرید Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra , خرید کتاب Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra ,
دیدگاهها
هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.