دانلود کتاب Metabolic Network Reconstruction and Modeling: Methods and Protocols – بازسازی و مدل سازی شبکه متابولیک: روش ها و پروتکل ها

This volume looks at the latest methodologies used to study cellular metabolism with in silico approaches. The chapters in this book are divided into 3 parts: part I discusses tools and methods used for metabolic reconstructions and basic constraint-based metabolic modeling (CBMM); Part II explores protocols for the generation of experimental data for metabolic reconstruction and modeling, including transcriptomics, proteomics, and mutant generations; and Part III cover advanced techniques for quantitative modeling of cellular metabolism, including dynamic Flux Balance Analysis and multi-objective optimization. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Cutting-edge and thorough, Metabolic Network Reconstruction and Modeling: Methods and Protocols is a valuable resource for qualified investigators studying cellular metabolism, and novice researchers who want to start working with CBMM.

این جلد به آخرین روش‌های مورد استفاده برای مطالعه متابولیسم سلولی با رویکردهای سیلیکو می‌پردازد. فصل‌های این کتاب به 3 بخش تقسیم شده‌اند: بخش اول درباره ابزارها و روش‌های مورد استفاده برای بازسازی متابولیک و مدل‌سازی متابولیک مبتنی بر محدودیت اساسی (CBMM) بحث می‌کند. بخش دوم پروتکل‌هایی را برای تولید داده‌های تجربی برای بازسازی و مدل‌سازی متابولیک، از جمله رونویسی، پروتئومیکس، و نسل‌های جهش یافته را بررسی می‌کند. و بخش سوم تکنیک‌های پیشرفته‌ای را برای مدل‌سازی کمی متابولیسم سلولی، از جمله تجزیه و تحلیل تعادل شار پویا و بهینه‌سازی چند هدفه را پوشش می‌دهد. این فصل‌ها با فرمت بسیار موفق Methods in Molecular Biology نوشته شده‌اند و شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام و قابل تکرار آسان و نکاتی در مورد عیب‌یابی است. و اجتناب از تله‌های شناخته شده منبعی ارزشمند برای محققین واجد شرایطی که در حال مطالعه متابولیسم سلولی هستند و محققان تازه کار که می خواهند کار با CBMM را شروع کنند.