دانلود کتاب Reverse Vaccinology – واکسنولوژی معکوس

توضیحات

For many, the semantics of the term reverse vaccinology may be puzzling. Literally, it implies a

complete change of direction or action in the study of vaccines. The non-obvious point is that this

volte face first came about through whole genome sequencing (WGS). WGS revolutionized biology,

including microbiology. Specifically, it introduced a top-down, computer data-based approach to

the discovery of candidate vaccine antigens; highly sensitive, but not specific and, crucially, not

hypothesis driven. This contrasted with the classical laboratory based, hypothesis driven analysis

of microbes to identify components that could elicit protective immunity. Reverse vaccinology

relies on the use of computational methods and tools to identify vaccine candidates for further

experimentation, refinement of which is crucial for their optimal use as argued and detailed by

Dalsass et al. These computational tools serve to anticipate antigens that are likely to induce

protective responses as well as the precise antigen regions, epitopes, recognized by the immune

system (1).

Reverse vaccinology was first used to predict potential antigens for a vaccine against the B strains

of Neisseria meningitidis (meningococci) in the 1990s, reviewed by Masignani et al. It is worth

emphasizing that the formulation of this complex vaccine could not have been achieved without

the systematic, WGS-based approach to population biology succinctly captured in the review by

Maiden, a pioneer in laying the foundations of the molecular epidemiological tools so crucial to

the design of vaccines both for infectious and non-infectious diseases. More recently, Bianconi

et al. have been successful in applying the classical reverse vaccinology approach for Pseudomonas

aeruginosa. Starting from the 5,570 open reading frames of the genome, they selected 52 vaccine

candidates by applying a number of filters to exclude the proteins predicted not to be present on the

bacterial surface, to be variable in different strains, to have homology to human proteins, or to be

homologous to E. coli proteins. Of the 52 predicted vaccine antigens, 30 were successfully expressed

and several of those gave a quite remarkable protection in the mouse challenge model. However,

one of the main aims of this current series on reverse vaccinology is to highlight how many new

concepts and technologies have been recruited to facilitate vaccine design including contributions

from proteomics, immunology, structural biology, systems biology, and mathematical modeling.

Thus today, the change of direction and action in vaccine research, captured in the term reverse

vaccinology, embodies much more than innovation in antigen discovery.

————————————————————–

ترجمه ماشینی :

برای بسیاری، معنای واژه واکسن شناسی معکوس ممکن است گیج کننده باشد. به معنای واقعی کلمه، به معنای تغییر کامل جهت یا اقدام در مطالعه واکسن است. نکته غیر مشهود این است که این صورت volte ابتدا از طریق توالی یابی کل ژنوم (WGS) به وجود آمد. WGS زیست شناسی، از جمله میکروبیولوژی را متحول کرد. به طور خاص، یک رویکرد مبتنی بر داده‌های رایانه‌ای از بالا به پایین برای کشف آنتی ژن‌های واکسن کاندید معرفی کرد. بسیار حساس، اما نه خاص و مهمتر از فرضیه نیست. این با تجزیه و تحلیل آزمایشگاهی کلاسیک مبتنی بر فرضیه میکروب‌ها برای شناسایی اجزایی که می‌توانند مصونیت محافظتی ایجاد کنند، در تضاد بود. واکسینولوژی معکوس بر استفاده از روش‌ها و ابزارهای محاسباتی برای شناسایی نامزدهای واکسن برای آزمایش‌های بیشتر تکیه می‌کند، که اصلاح آن‌ها برای استفاده بهینه از آن‌ها ضروری است، همانطور که دالس و همکارانش استدلال و تفصیل دادند. این ابزارهای محاسباتی برای پیش‌بینی آنتی‌ژن‌هایی هستند که احتمالاً پاسخ‌های محافظتی را القا می‌کنند و همچنین مناطق دقیق آنتی‌ژن، اپی‌توپ‌هایی که توسط سیستم ایمنی شناسایی می‌شوند (1). واکسن شناسی معکوس برای اولین بار برای پیش بینی آنتی ژن های بالقوه برای یک واکسن علیه سویه های B نایسریا مننژیتیدیس (مننگوکوک) در دهه 1990 مورد استفاده قرار گرفت که توسط Masignani و همکاران بررسی شد. شایان ذکر است که فرمولاسیون این واکسن پیچیده بدون رویکرد سیستماتیک و مبتنی بر WGS به زیست شناسی جمعیت که به اختصار در بررسی توسط میدن، پیشگام در پایه گذاری ابزارهای اپیدمیولوژیک مولکولی به طور خلاصه شرح داده شده است، به دست نمی آید. برای طراحی واکسن ها برای بیماری های عفونی و غیر عفونی بسیار مهم است. اخیراً، بیانکونی و همکاران. در بکارگیری رویکرد واکسینولوژی معکوس کلاسیک برای سودوموناس آئروژینوزا موفق بوده اند. با شروع از 5570 فریم خواندن باز ژنوم، آنها 52 واکسن / نامزد را با اعمال تعدادی فیلتر انتخاب کردند تا پروتئین‌های پیش‌بینی‌شده در سطح باکتری وجود نداشته باشند، در گونه‌های مختلف متغیر باشند، و همسانی با انسان داشته باشند. پروتئین ها یا همولوگ بودن با پروتئین های E. coli. از 52 آنتی ژن پیش‌بینی‌شده واکسن، 30 آنتی‌ژن با موفقیت بیان شدند و تعدادی از آن‌ها محافظت کاملاً قابل‌توجهی در مدل چالش موش ارائه کردند. با این حال، یکی از اهداف اصلی این مجموعه فعلی در مورد واکسن شناسی معکوس، برجسته کردن تعداد مفاهیم و فناوری های جدیدی است که برای تسهیل طراحی واکسن از جمله مشارکت های پروتئومیکس، ایمونولوژی، زیست شناسی ساختاری، زیست شناسی سیستم ها و مدل سازی ریاضی به کار گرفته شده اند. بنابراین امروزه تغییر جهت و اقدام در تحقیقات واکسن، که در اصطلاح معکوس واکسینولوژی به کار رفته است، بسیار بیشتر از نوآوری در کشف آنتی ژن است.

tag : دانلود کتاب واکسنولوژی معکوس , Download واکسنولوژی معکوس , دانلود واکسنولوژی معکوس , Download Reverse Vaccinology Book , واکسنولوژی معکوس دانلود , buy واکسنولوژی معکوس , خرید کتاب واکسنولوژی معکوس , دانلود کتاب Reverse Vaccinology , کتاب Reverse Vaccinology , دانلود Reverse Vaccinology , خرید Reverse Vaccinology , خرید کتاب Reverse Vaccinology ,